辞职后扣工资不发年终奖肯定是属于不合法的；年终奖属于《劳动法》规定的工资总额的组成。根据《劳动法》规定，工资总额是指各单位在一定时期内直接支付给本单位职工的劳动报酬总额，由计时工资、计件工资奖金、津贴和补贴、加班加点工资、特殊情况下支付的工